| Kommentar |
Dieses Seminar richtet sich an Biotechnologen und Interessierte aus allen Fachrichtungen, die sich das notwendige Wissen aneignen möchten, um RNA-seq und verwandte Verfahren wie CUT&RUN, CHIP-seq oder ATAC-seq eigenständig durchzuführen. Im Mittelpunkt stehen die Workflows der nf-core Community, die technisch auf der Nextflow-Plattform basieren. Die Veranstaltung beginnt mit den grundlegenden Begriffen zu Hardware, Netzwerk und UNIX und führt bis hin zur Interpretation biologischer Ergebnisse. Ziel ist es, die Teilnehmer in die Lage zu versetzen, eigenständig komplexe bioinformatische Analysen durchzuführen, zu verstehen und eine Anpassung an einen eigenen Bedarf formulieren zu können |
| Lerninhalte |
Rechner-Grundkenntnisse, UNIX, Skript-Programmierung, Workflows, Genom-Alignment, Differentielle Expression, Webseiten zur interaktiven Präsentation von Ergebnissen
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