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Publikation: Teil einer Monographie/eines Konferenzbandes

Towards enhanced retrieval of biological models through annotation-based ranking


Grunddaten

Titel Towards enhanced retrieval of biological models through annotation-based ranking
Veröffentlicht in Data integration in the life sciences : 6th international workshop, DILS 2009, Manchester, UK, July 20-22, 2009 ; proceedings. - Berlin [u.a.]: Springer
Erscheinungsjahr 2009
Seiten (von – bis) 204 – 219
Jahr 2009
Publikationsform Druckschrift
Publikationsart Teil einer Monographie/eines Konferenzbandes
Sprache Englisch
Letzte Änderung 17.05.2019 15:40:47
Bearbeitungsstatus durch UB Rostock abschließend validiert
Dauerhafte URL http://purl.uni-rostock.de/fodb/pub/31889
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Abstract

Modelling and simulation methods gain increasing importance for the understanding of biological systems. The growing number of available computational models makes support in maintenance and retrieval of those models essential to the community. This article discusses which model information are helpful for efficient retrieval and how existing similarity measures and ranking techniques can be used to enhance the retrieval process, i. e. the model reuse. With the development of new tools and modelling formalisms, there also is an increasing demand for performing search independent of the models’ encoding. Therefore, the presented approach is not restricted to certain model storage formats. Instead, the model meta-information is used for retrieval and ranking of the search result. Meta-information include general information about the model, its encoded species and reactions, but also information about the model behaviour and related simulation experiment descriptions.

Autoren

Köhn, Dagmar
Maus, Carsten
Henkel, Ron
Kolbe, Martin

Einrichtung

IEF/Bereich Informatik